Какую программу лучше использовать для преобразования в формат PDF/A из верстки, созданной в InDesign?

Наиболее часто используемый вариант — Adobe Acrobat (желательно одной из последних версий).
Рекомендуем также обратиться к вопросу «Как создать PDF/A-файл из верстки с изданием?».